定量PCR儀針對一些感染性疾病的藥物，如各種病毒病、細(xì)菌病等，在新藥的開發(fā)過程中，快速了解藥物對疾病進(jìn)程的影響可以為新藥開發(fā)節(jié)約大量的人力、時(shí)間和資金，與以前所用的Elisa等方法相比，實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)可以快速、準(zhǔn)確、定量、靈敏地測定血液或組織中病原體的含量，因此有利用分析藥物的作用效果，為比較不同的配方的療效、用藥量、用藥時(shí)間等等提供快速、定量的評價(jià)。
　　此方法除了用于人用藥物以外，還可以用于畜用藥物，甚至其他經(jīng)濟(jì)動物及植物的藥物研究等，因此其在藥物研究方面的應(yīng)用范圍是很廣的。
　　實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的方法測定是血液中病毒核酸的含量，因此不必等到病人體內(nèi)產(chǎn)生抗體，同時(shí)，由于其靈敏度與Elisa相比不可同日而語，在病毒感染的早期，即血液中病毒含量很低時(shí)就可以測定。因此就出現(xiàn)了一個(gè)新的領(lǐng)域，即在病毒或細(xì)菌含量很低時(shí)如何用藥，用什么藥以及用藥量等進(jìn)行研究，為將疾病消滅在超早期作出貢獻(xiàn)。
　　現(xiàn)有的很多診斷及檢驗(yàn)方法都不能同時(shí)滿足快速、靈敏、定量的要求如現(xiàn)有培養(yǎng)法、Elisa法等等，而定量PCR儀的方法以則可以做到這一點(diǎn)，從而可為臨床疾病、商檢、糧油檢驗(yàn)、食品檢驗(yàn)、血液檢驗(yàn)等等開發(fā)新的試劑，從而提高檢驗(yàn)的靈敏度、速度及準(zhǔn)確性等；這類試劑的種類是非常多的，所開發(fā)的試劑的社會效益及經(jīng)濟(jì)效益都是很巨大的。
　　由于定量PCR儀的方法的快速、靈敏、定量的特點(diǎn)，其在研究及開發(fā)方面的應(yīng)用是不勝枚舉的，如研究個(gè)人基因型與藥物療效之間的關(guān)系等；研究人員也可以根據(jù)自已研究項(xiàng)目開發(fā)其新的用途。